Java-плагин

Поддержка Java  (не путать с JavaScript) была отключена в Яндекс Браузере ещё в июле 2016 года и это общая тенденция среди софт разработчиков. Веб версия Java, как и некоторые другие плагины (Flash Player, Unity) основана ещё на технологии NPAPI, перекочевавшей из Netscape и не способной сейчас соответствовать современным стандартам безопасности и стабильности.

Для Flash Player была выпущена новая версия на основе PPAPI, которая успешно поддерживалась и работала вплоть до конца 2020. Для запуска же Java приложений через Яндекс Браузер можно использовать вариант с Web Start, в таком виде они будут работать независимо. С примером можно ознакомиться по ссылке. Общий принцип заключается в том, что вы оставляете в нужном месте страницы сайта ссылку на файл с расширением jnlp, при клике на неё Java Web Start будет запускать приложение, основываясь на инструкциях в jnlp-файле.